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博濟(jì)醫(yī)藥科技股份有限公司
股票代碼為(300404)創(chuàng)建于2002年,2015年在深圳創(chuàng)業(yè)板上市,是一家為國(guó)內(nèi)外醫(yī)藥企業(yè)提供藥品、保健品、醫(yī)療器械研發(fā)與生產(chǎn)全流程“一站式”外包服務(wù)(CRO)的型高新技術(shù)企業(yè),同也提供藥品上市許可持有人(MAH)服務(wù)。
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公司擁有近3000平米的現(xiàn)代化辦公場(chǎng)所,匯聚了超1000名經(jīng)驗(yàn)豐富,學(xué)識(shí)淵博,思維敏捷的中高級(jí)醫(yī)藥研究人才和注冊(cè)法規(guī)專家。
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博濟(jì)醫(yī)藥始終堅(jiān)持“誠(chéng)實(shí)、守信、專業(yè)、權(quán)威”的經(jīng)營(yíng)理念,截至2020年,公司累計(jì)為客戶提供臨床研究服務(wù)800余項(xiàng),基本涵蓋了藥物治療的各個(gè)專業(yè)領(lǐng)域;累計(jì)完成臨床前研究服務(wù)500多項(xiàng)。經(jīng)過(guò)近二十年的發(fā)展,博濟(jì)醫(yī)藥在技術(shù)實(shí)力、服務(wù)質(zhì)量、服務(wù)范圍、營(yíng)業(yè)收入、團(tuán)隊(duì)建設(shè)等方面都已躋身我國(guó)CRO公司的領(lǐng)先位置,成為我國(guó)本土大型CRO公司的龍頭企業(yè)。
公司新聞
袁來(lái)如此| 大分子生物分析概論(四_下): LBA校準(zhǔn)曲線擬合模型和權(quán)重的選擇 ?
作者:廣州博濟(jì)醫(yī)藥 時(shí)間:2021-03-23 來(lái)源:廣州博濟(jì)醫(yī)藥

上周,“袁來(lái)如此”專欄就大分子生物分析方法的校準(zhǔn)曲線的設(shè)計(jì)、生成和編輯的思考和建議展開(kāi)了詳細(xì)介紹袁來(lái)如此|大分子生物分析概論(四_上):校準(zhǔn)曲線的設(shè)計(jì),生成和編輯,本期將延續(xù)上期內(nèi)容,重點(diǎn)介紹大分子生物分析方法校準(zhǔn)曲線擬合模型和權(quán)重進(jìn)行取舍的方法。


本系列文章介紹的生物分析是指定量地測(cè)定在動(dòng)物和人體體液或組織中的生物藥(本文特指蛋白質(zhì)類生物藥,包括單抗,細(xì)胞因子,生長(zhǎng)素,融合蛋白等)的濃度。大多數(shù)生物分析方法都基于免疫測(cè)試方法(Immunoassays),或者更廣義地稱為,配體結(jié)合式測(cè)試方法(ligand binding assays, LBA)。這些方法涉及一系列試劑的使用,如抗藥物抗體,其它抗體,生物藥的靶標(biāo)蛋白等。

1.導(dǎo)論

配體結(jié)合式測(cè)試方法(LBA,也稱為immunoassays)是一種常用的定量分析工具。在LBA方法中,待測(cè)物濃度與響應(yīng)數(shù)據(jù)之間的關(guān)系是質(zhì)量作用定律驅(qū)動(dòng)的非線性關(guān)系,兩個(gè)被廣泛接受和經(jīng)過(guò)驗(yàn)證的LBA校準(zhǔn)曲線的回歸模型是4參數(shù)logistic(4PL)和5參數(shù)logistic(5PL)曲線擬合模型。選擇適當(dāng)?shù)幕貧w模型和權(quán)重函數(shù)是LBA方法開(kāi)發(fā)的關(guān)鍵組成部分。

在分析方法開(kāi)發(fā)期間,應(yīng)對(duì)選定的模型和權(quán)重函數(shù)進(jìn)行評(píng)估,并在驗(yàn)證期間加以確認(rèn)。關(guān)于確定或選擇適當(dāng)?shù)幕貧w模型和權(quán)重函數(shù)的實(shí)際操作方法,在已發(fā)表的文獻(xiàn)中頗為有限,本文將提出一個(gè)結(jié)構(gòu)化的、有序的方案來(lái)確定兩者。

在LBA中觀察到的實(shí)驗(yàn)響應(yīng)是一個(gè)配體(待測(cè)物)和檢測(cè)系統(tǒng)中使用的特定捕獲/檢測(cè)試劑的平衡結(jié)合的結(jié)果。實(shí)驗(yàn)響應(yīng)與對(duì)數(shù)變換后濃度之間的這種關(guān)系是非線性的,使得典型的LBA校準(zhǔn)曲線為全部或部分的S型(sigmoidal)。常見(jiàn)的非線性回歸模型為4PL和5PL,擬合模型的選擇可能由曲線的形狀所驅(qū)動(dòng)。完全的 sigmoidal曲線(其中頂部和底部平臺(tái)區(qū)是鏡像)通常使用4PL 模型。部分sigmoidal曲線,即非對(duì)稱曲線,通常使用5PL模型(4PL、5PL模型詳細(xì)解讀請(qǐng)戳《袁來(lái)如此|大分子生物分析概論(四_上):校準(zhǔn)曲線的設(shè)計(jì),生成和編輯》)。

由于LBA中配體平衡結(jié)合(equilibrium binding)的特性,經(jīng)常會(huì)觀察到測(cè)試響應(yīng)的非恒定的方差(non-constant variance of response),這種不等同方差稱為異方差性(heteroscedasticity)。如果在曲線擬合時(shí)不考慮應(yīng)對(duì)異方差性,則可能導(dǎo)致最終結(jié)果中出現(xiàn)回算錯(cuò)誤和更大的偏差。為了減少異方差性的影響并提高曲線擬合的質(zhì)量,必須盡量減少具有較高方差(higher variance)的校準(zhǔn)點(diǎn)對(duì)曲線擬合的貢獻(xiàn),廣義最小平方 (generalized least squares)和方差穩(wěn)定變換(variance stabilizing transformation)可以用來(lái)解決這個(gè)問(wèn)題。這些方法要么在每個(gè)擬合迭代后更新權(quán)重函數(shù);要么轉(zhuǎn)換數(shù)據(jù)和模型,以使用普通最小平方模型,而不使用權(quán)重函數(shù)。在已發(fā)表的方法中,線性回歸斜率方法(linear regression slope approach)可能是最實(shí)用的。本文下面討論這個(gè)方法。

大多數(shù)與 LBA測(cè)試相關(guān)的軟件為各種擬合模型和常用的權(quán)重函數(shù)(如 1/Y 或 1/Y2)提供了內(nèi)置的選擇。相關(guān)監(jiān)管指南建議使用最簡(jiǎn)單,并充分描述了待測(cè)物濃度與其響應(yīng)之間關(guān)系的模型。在選擇回歸模型(加或不加權(quán)重)時(shí),如果對(duì)曲線形狀的目視評(píng)估和對(duì)使用的統(tǒng)計(jì)方法進(jìn)行比較,如比較F測(cè)試和chi-square p value,并不容易,其結(jié)果可能會(huì)令人困惑。這里常見(jiàn)的挑戰(zhàn)是如何依據(jù)相關(guān)知識(shí),合理地選擇其中之一。

本文將介紹一組案例研究,其中采用藥代動(dòng)力學(xué)定量分析方法,用于血清或血漿中蛋白生物藥的定量,以及使用通用的統(tǒng)計(jì)軟件來(lái)確定適當(dāng)?shù)臄M合模型和權(quán)重因子。

2.定量分析數(shù)據(jù)的產(chǎn)生

LBA方法是評(píng)估生物藥的PK/TK時(shí)的主要定量分析方法,該方法的特異性和選擇性取決于目標(biāo)待測(cè)物與其他生物分子(如受體、和針對(duì)候選生物藥的抗體)的相互作用。LBA方法中觀察到的信號(hào)/響應(yīng)與生物藥的濃度間接相關(guān)。

下面的示例A、B和C都使用了LBA方法,如電化學(xué)發(fā)光(ECL)檢測(cè)平臺(tái)或比色法ELISA檢測(cè)平臺(tái),用于定量分析血漿或血清(人或食蟹猴)中的蛋白生物藥濃度。每個(gè)案例研究中的分析方法簡(jiǎn)述如下:

案例A:對(duì)Meso Scale Discovery(MSD)Multi-Array?微孔板,使用單克隆抗藥物抗體(5 ?g/mL)包板,過(guò)夜;之后,與含有藥物的樣品在室溫下孵育60分鐘;洗板后,結(jié)合到板上的藥物與biotinylated單克隆檢測(cè)抗體(2.5??g/mL)孵育60分鐘;然后加入0.1??g/mL 的Streptavidin-ruthenium,再孵育60分鐘;之后,MSD儀器在特定條件下檢測(cè)到來(lái)自ruthenium 的電化學(xué)發(fā)光信號(hào)。

案例B:對(duì)streptavidin 包被的MSD Multi-Array?微孔板,在室溫下,以biotinylated單克隆抗體(4mg/mL)包板60至120分鐘;隨后,含有藥物的樣品在上述微孔板上孵育90分鐘;使用小鼠抗人IgG Fc-Ruthenium(0.36mg/mL)孵育60分鐘,以結(jié)合被抗體捕獲的生物藥;之后,MSD儀器在特定條件下檢測(cè)到來(lái)自ruthenium 的電化學(xué)發(fā)光信號(hào)。

案例C:在Costar微孔板上,在4°C包被藥物靶點(diǎn)(4 mg/mL),過(guò)夜;與靶點(diǎn)結(jié)合后的生物藥,再與50 ng/mL的biotinylated單克隆抗體孵育60分鐘;之后,再與1:50,000稀釋后的avidin D-HRP 孵育60分鐘;隨后,加入HRP酶底物,TMB,以產(chǎn)生色度反應(yīng);然后用硫酸停止該反應(yīng),并在酶標(biāo)儀Spectramax上,測(cè)量450nm的光學(xué)密度(OD)。

3.數(shù)據(jù)分析的過(guò)程

異方差性(Heteroscedasticity)

在采集到的實(shí)驗(yàn)運(yùn)行的標(biāo)準(zhǔn)校準(zhǔn)數(shù)據(jù)集合(standard calibration data)中,可以通過(guò)觀察測(cè)試信號(hào)的標(biāo)準(zhǔn)偏差(SD)和校準(zhǔn)點(diǎn)濃度之間的關(guān)系來(lái)評(píng)估異方差性。為此,分別評(píng)估了案例A、B和C在方法開(kāi)發(fā)過(guò)程中獲得的6、7和10個(gè)獨(dú)立運(yùn)行。

首先,使用Microsoft Excel 2010計(jì)算標(biāo)準(zhǔn)方差,其次使用 GraphPad Prizm 7 來(lái)繪制每個(gè)校準(zhǔn)品測(cè)試信號(hào)的SD與校準(zhǔn)點(diǎn)濃度的關(guān)系圖。在目視考查了SD變化的趨勢(shì)后,就可以確定對(duì)權(quán)重函數(shù)的需求。如果SD發(fā)生移動(dòng),則表明了異方差性,因此,需要使用權(quán)重函數(shù)。如果SD在校準(zhǔn)品濃度范圍內(nèi)是恒定的,則無(wú)需加權(quán)。

確定權(quán)重函數(shù)

當(dāng)在校準(zhǔn)曲線中觀察到測(cè)試信號(hào)的標(biāo)準(zhǔn)偏差隨濃度發(fā)生變化時(shí),就需要對(duì)更精確的數(shù)據(jù)點(diǎn)(具有較低SD的數(shù)據(jù))使用權(quán)重函數(shù)來(lái)調(diào)整曲線的擬合。在 GraphPad Prizm 7 中,可以使用圖形線性回歸方法(graphical linear regression approach)計(jì)算權(quán)重函數(shù)因子如下:

步驟1. 繪制下述二者的關(guān)系圖:對(duì)數(shù)轉(zhuǎn)換后的測(cè)試信號(hào)平均值與對(duì)數(shù)轉(zhuǎn)換后的SD,對(duì)二者使用相同的對(duì)數(shù)底數(shù)(10或2)。

步驟2. 在步驟1中得到的線性回歸直線的斜率值(k)乘以2,以確定權(quán)重函數(shù)因子(weighting function factor),即2k。

為了平衡所有校準(zhǔn)點(diǎn)的貢獻(xiàn),在4PL或5PL曲線擬合中應(yīng)用權(quán)重函數(shù) 1/Y2k(其中Y是測(cè)試信號(hào),2k是權(quán)重因子),以盡量減少weighted sum-of-squares,從而獲得更好的準(zhǔn)確度和精密度。

確定曲線擬合模型

將權(quán)重函數(shù) 1/Y2k 應(yīng)用于曲線擬合模型 (4PL 或 5PL)后,再使用Watson LIMS,將回算的校準(zhǔn)點(diǎn)濃度插入加權(quán)擬合的曲線(假定這些校準(zhǔn)點(diǎn)是未知濃度的樣本)。

如果對(duì)所有測(cè)試運(yùn)行和對(duì)每個(gè)標(biāo)準(zhǔn)校準(zhǔn)點(diǎn)(錨定點(diǎn)除外),累積%RE在±15% 之內(nèi)并且累積%CV≤15%,則回歸模型是可以接受的;但對(duì)于定量下限(LLOQ)和上限(ULOQ),接受標(biāo)準(zhǔn)一般 %RE±20和累積 %CV≤20。估計(jì)的定量范圍(ROQ)是在符合上述接受標(biāo)準(zhǔn)的最低和最高標(biāo)準(zhǔn)濃度之間確定的。在 MS  Excel 2010 中,累計(jì)%RE和累積%CV 分別計(jì)算為:[100 - 100 x(回算濃度的平均值/標(biāo)稱濃度)]和 100 X(回算濃度的標(biāo)準(zhǔn)方差/回算濃度的平均值)。

之后,使用 GraphPad Prizm 7 繪制 4PL 和 5PL 之間準(zhǔn)確度(累積cumulative %RE)和精密度(累積cumulative %CV)的比較圖。回歸模型的適宜性可使用此可視化圖形工具來(lái)判斷:在可接受的范圍內(nèi)包含了更多標(biāo)準(zhǔn)校準(zhǔn)點(diǎn),而且累積 %RE 和累積 %CV 較低模型,就是應(yīng)該選擇的模型。如果兩種模型的效能非常相似,則可通過(guò)是否具有加權(quán)4PL來(lái)做選擇 ,因?yàn)橐话阕裱?Occam’s razor 原則, 即以最少的假設(shè),發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)和模型之間的關(guān)系。

圖1. 選擇曲線擬合模型以提高曲線性能的方法。實(shí)際工作流程描述了選擇權(quán)重函數(shù)和曲線擬合模型的每個(gè)步驟和整個(gè)過(guò)程。





4.結(jié)果

本文提出了一種結(jié)構(gòu)化的方法,通過(guò)選擇正確的曲線擬合模型和權(quán)重函數(shù),以擴(kuò)展 LBA分析方法的定量范圍(圖1)。該方法完全從數(shù)學(xué)的角度出發(fā),確定一條校準(zhǔn)曲線是否需要加權(quán)重以及哪種加權(quán)方式最合理。如果收集到的數(shù)據(jù)中呈現(xiàn)出的異質(zhì)性,則在準(zhǔn)確度和精密度行為方面,對(duì)4PL和5PL兩個(gè)模型(以及確定的權(quán)重函數(shù))進(jìn)行比較;如果未觀察到異方差性,則對(duì)不含權(quán)重量4PL和5PL模型進(jìn)行比較。以下將此原則應(yīng)用于3個(gè)典型 LBA分析案例。在這3個(gè)生物藥的藥代動(dòng)力學(xué)(PK)研究案例中,總共開(kāi)發(fā)了3個(gè)分析方法,并觀察到3種不同形狀的校準(zhǔn)曲線。其中,兩個(gè)分析方法(案例A和B)利用了電化學(xué)發(fā)光(ECL)平臺(tái),而另一個(gè)分析方法(案例C)使用了比色ELISA平臺(tái)。

PK分析的3條校準(zhǔn)曲線

為了在方法開(kāi)發(fā)過(guò)程中對(duì)濃度-測(cè)試信號(hào)的關(guān)系進(jìn)行詳細(xì)研究,表1中描述了定量分析生物藥A、B和C濃度的3條校準(zhǔn)曲線。在預(yù)期的定量范圍內(nèi)(對(duì)數(shù)尺度上),校準(zhǔn)點(diǎn)大致均勻分布。

表1. 3條PK校準(zhǔn)曲線的特征總結(jié)

用于評(píng)估各自PK分析運(yùn)行的校準(zhǔn)曲線數(shù)據(jù)如圖2所示。在所有3個(gè)案例研究中都觀察到了典型的非線性的濃度-響應(yīng)曲線。

圖2. 3個(gè)案例研究中的校準(zhǔn)曲線:案例 A(a),案例 B(b) 和案例 C(c)。該圖展示了3條標(biāo)準(zhǔn)曲線的形狀,代表了在LBA測(cè)試中通常觀察到的典型非線性響應(yīng)。X軸代表校準(zhǔn)點(diǎn)濃度的對(duì)數(shù),Y軸代表響應(yīng)讀數(shù):案例A和B是相對(duì)光單位(RLU),案例C是450 nM 光學(xué)密度(OD 450)。



圖3. 案例A(a)、案例B(b)和案例C(c)的異方差性概況。X軸代表校準(zhǔn)點(diǎn)濃度的對(duì)數(shù),Y軸代表實(shí)驗(yàn)運(yùn)行中測(cè)試信號(hào)的SD。





異方差性評(píng)估

下面評(píng)估了表1中3條校準(zhǔn)曲線上測(cè)試信號(hào)的標(biāo)準(zhǔn)偏差(SD),該SD是異方差性的直接指標(biāo)。這3條校準(zhǔn)曲線上測(cè)試信號(hào)的SD(變異性variability)不是恒定的,而是隨著校準(zhǔn)點(diǎn)的濃度而改變化的(圖3)。

對(duì)于案例A,當(dāng)藥物濃度超過(guò) 20 ng/mL時(shí),其變異性急劇增加。在案例B中,SD大幅增加,直到48.3 ng/mL的濃度,并在 48.3和 250 ng/mL 之間出現(xiàn)下降趨勢(shì)。對(duì)于案例C ,SD 增加,一直到23.5 ng/mL的濃度,之后稍微降,直至79.3 ng/mL。總體而言,濃度較高校準(zhǔn)點(diǎn)的SD大于濃度較低校準(zhǔn)點(diǎn)。校準(zhǔn)曲線之間的非恒定 SD 模式代表示異方差性,在較高濃度下的高變異性表明需要使用加權(quán)擬合。圖1所示的決策樹(shù)指明了如何確定適當(dāng)?shù)臋?quán)重因子和可以接受的擬合模型。

確定權(quán)重函數(shù)

為了確定權(quán)重因子,首先需要從下面的線性回歸中得出斜率(k值):對(duì)數(shù)變換的測(cè)試信號(hào)SD vs 對(duì)數(shù)變的換測(cè)試信號(hào)平均值(圖4);然后,應(yīng)用 1/Y2k 方程式來(lái)計(jì)算最終的權(quán)重函數(shù)。對(duì)于案例 A,B 和 C,線性回歸的斜率分別為 1.06、1.00 和 0.657。對(duì)于案例 A 和 B,由于斜率接近1.0,因此在4PL和5PL模型中使用了權(quán)重函數(shù)1/Y2 。對(duì)于 C 例,權(quán)重函數(shù)為 1/Y,由于斜率接近 0.5。在Waston LIMS中,只有 1/Y or 1/Y2這兩種權(quán)重函數(shù)可用。

圖4. 案例 A(a)、案例 B (b) 和案例 C (c)中k值的確定。案例 A、B 和 C 的斜率(k值)分別為 1.06、1.00 和 0.657。案例A、B和C的R2(確定系數(shù)coefficient of determination)分別為0.998、0.984和0.934。





確定曲線擬合模型

為確定可以接受的曲線擬合模型,考察了如下參數(shù):4PL和 5PL模型;權(quán)重函數(shù):1/Y2(案例A),1/Y2(案例B)和 1/Y(案例C);比較參數(shù):回算濃度的累積 %RE(圖5)和累積 %CV(圖6)。應(yīng)當(dāng)選擇在可接受的范圍內(nèi),具有較低的%CV和%RE校準(zhǔn)點(diǎn)數(shù)量較多的回歸模型。如果兩者都是相當(dāng)?shù)模瑒t應(yīng)選取加權(quán)4PL作為最終的曲線擬合模型。在 Watson LIMS 中生成每次運(yùn)行的回算濃度。所有情況的回算濃度的累積 %RE和 %CV計(jì)算(在曲線擬合模型確定章節(jié)的 B 部分)。圖5和圖6給出了加權(quán)4PL模型與加權(quán)5PL模型的累積 %RE和累積 %CV的比較。

如圖5所示,對(duì)于具有相應(yīng)權(quán)重函數(shù)的4PL和5PL模型,所有校準(zhǔn)點(diǎn)的 %RE分別:案例A, 低于4%和3%;案例 B,低于18%和16%;案例 C,低于7 和 6%。在所有案例研究中,加權(quán)4PL和加權(quán)5PL模型的準(zhǔn)確度是相當(dāng)?shù)模瑢?duì)于案例 A、B 和 C,所有校準(zhǔn)點(diǎn)都在可以接受的范圍內(nèi)。根據(jù)準(zhǔn)確度行為圖推斷的定量范圍(ROQ)分別為:0.317-178 ng/mL(案例A),0.602-250 ng/mL(案例B),和1.37-79.3 ng/mL(案例C)。

圖5. 準(zhǔn)確度行為圖。對(duì)案例A(a)、案例B(b)和案例C(c)中校準(zhǔn)曲線的加權(quán)(1/Y或者1/Y2)擬合模型進(jìn)行了比較。比較模型:4PL vs 5PL;比較參數(shù):回算濃度的累積相對(duì)誤差(%RE)。兩條虛線之間的區(qū)域是可接受范圍(± 20%)。(○)代表4PL加權(quán)擬合,(□)代表5PL加權(quán)擬合。



圖6顯示,對(duì)于加權(quán)4PL和加權(quán)5PL曲線擬合模型,所有校準(zhǔn)點(diǎn)的累計(jì)%CV:案例A,低于3.0和2.9%;案例B,低于39.7%和26.3%;案例C,低于6.6%和10.8%。案例A和C對(duì)兩個(gè)擬合模型加權(quán)擬合后,所有校準(zhǔn)點(diǎn)的 %CV變得相當(dāng)了。對(duì)案例A和C,所有校準(zhǔn)點(diǎn)的加權(quán)4PL和加權(quán)5PL的精密度也是相似的。根據(jù)精密度行為圖推斷的ROQ分別為0.317-178 ng/mL(案例A)和1.37-79.3 ng/mL(案例C)。使用加權(quán)4PL模型,與加權(quán)5PL模型相比,案例B可以接受的校準(zhǔn)點(diǎn)數(shù)量從9增加到11,加權(quán)4PL模型的估算的ROQ 為 0.602-145 ng/mL,而加權(quán)5PL模型的檢測(cè)范圍較窄:0.602 - 48.3 ng/mL。根據(jù)接受標(biāo)準(zhǔn),對(duì)于案例 A、B 和 C ,最終可以接受的曲線擬合模型都是4PL,權(quán)重函數(shù)分別為 1/Y2,1/Y2和1/Y。

圖6. 精密度行為圖:案例A(a),案例B(b)和案例C(c)比較模型:加權(quán)4PL vs 加權(quán)5PL;比較參數(shù):回算濃度的 %CV。虛線和X軸之間的區(qū)域是可接受范圍(± 20%)。(○)代表 4PL 加權(quán)擬合,(□)代表 5PL 加權(quán)擬合。



使用上述方案后,校準(zhǔn)曲線性能的改進(jìn)

圖7演示了對(duì)案例 A 應(yīng)用上述方案后,校準(zhǔn)曲線性能是如何改進(jìn)的(此處不顯示案例B和C的圖表)。使用非加權(quán)4PL回歸模型回算濃度繪制的準(zhǔn)確度行為圖(累積 %RE,圖7a)表明,與加權(quán)相比此模型表現(xiàn)出更窄的動(dòng)態(tài)范圍,0.563-178 ng/mL;加權(quán)4PL模型:0.317-178 ng/mL。非加權(quán) 5PL回歸模型顯示更好的準(zhǔn)確度:所有校準(zhǔn)點(diǎn)低于20%。但是,在應(yīng)用1/Y2的權(quán)重函數(shù)(在“異方差度評(píng)估”章節(jié)確定)后, 所有校準(zhǔn)點(diǎn)的累積 %RE得到改善,都在±3%以內(nèi)(圖7a)。

精密度行為圖(累積 %CV,圖7b)顯示,非加權(quán)4PL和5PL回歸模型的ROQ顯著狹窄:1.00-178 ng/mL;而在使用了1/Y2 的權(quán)重函數(shù)后,ROQ變?yōu)?.317-178 ng/mL。該校準(zhǔn)曲線低端的效能的顯著改善顯示了加權(quán)擬合的力量,因其降低了高變異性的測(cè)試信號(hào)對(duì)曲線擬合的影響。案例A表明,使用適當(dāng)?shù)臋?quán)重函數(shù)可以提高精密度和準(zhǔn)確度(均低于4%)以及擴(kuò)展定量范圍(0.317-178 ng/mL)。

圖7. 案例A標(biāo)準(zhǔn)曲線加權(quán)之前和之后,4PL和5PL模型的準(zhǔn)確度和精密度行為圖。累積 %RE(圖 7a)和累計(jì) %CV(圖7b)在模型之間的比較:4PL vs. 5PL(無(wú)權(quán)重);以及4PL vs. 5PL(權(quán)重因子:1/Y2)。


表2顯示,使用適當(dāng)?shù)臋?quán)重函數(shù)可以擴(kuò)展ROQ。對(duì)案例B,應(yīng)用權(quán)重函數(shù)到4PL回歸模型后,ROQ得到顯著擴(kuò)展;從未加權(quán)的1.04-48.3 ng/mL到 加權(quán)的0.602-145 ng/mL;加權(quán)5PL模型的ROQ,則從未加權(quán)1.04-145 ng/mL變?yōu)榧訖?quán)的0.602-48.3 ng/mL。對(duì)案例C,4PL模型的ROQ略有擴(kuò)展:從未加權(quán)的2.06-79.3 ng/mL,到加權(quán)的1.37-79.3 ng/mL。對(duì)于5PL模型,使用權(quán)重函數(shù)后ROQ沒(méi)有增加。

表2. 定量范圍(ng/mL)

5.討論和結(jié)論

本文為確定LBA定量分析方法中校準(zhǔn)曲線的回歸模型及權(quán)重函數(shù)的選擇,提供了一個(gè)決策樹(shù)和相應(yīng)的方法,目的是為了為減少異方差性(heteroscedasticity)的影響。本文的建議得到3個(gè)案例研究的支持。

由于LBA中平衡結(jié)合(equilibrium binding)的特性,實(shí)踐中經(jīng)常觀察到測(cè)試響應(yīng)的非恒定方差,稱為異方差性(heteroscedasticity)。本文發(fā)現(xiàn)線性回歸斜率方法(linear regression slope approach)是解決異方差性最實(shí)際的方法。

在方法開(kāi)發(fā)過(guò)程中,可以繪制校準(zhǔn)曲線的測(cè)試信號(hào)的標(biāo)準(zhǔn)方差(standard deviation,SD)與校準(zhǔn)點(diǎn)濃度的對(duì)數(shù)的相關(guān)圖。一條校準(zhǔn)曲線的非恒定SD趨勢(shì)表明存在異方差性,這意味著需要使用權(quán)重函數(shù)。所有的3個(gè)案例研究(A,B 和 C)都顯示,測(cè)試信號(hào)在較高藥物濃度下,具有更高的變異性,需要加權(quán)擬合校準(zhǔn)曲線。一般而言,任何一個(gè)LBA定量分析方法,都會(huì)受益于使用權(quán)重函數(shù)。

需要注意的是,一旦確定需要權(quán)重因子,如何確定正確的權(quán)重因子則成為重中之重。本文推薦的方法是:首先,從測(cè)試信號(hào)(Y)的標(biāo)準(zhǔn)方差(對(duì)數(shù)變換后)與測(cè)試信號(hào)平均值(對(duì)數(shù)變換后)的線性回歸關(guān)系中,確定其斜率,又稱k值;然后,將斜率(k) 代入以下方程 1/Y2k 中,以確定權(quán)重因子(1/Y 或 1/Y2)。

在案例研究 A、B、C 中,線性回歸的斜率分別為 1.06,1.00 和 0.657; 因此,權(quán)重因子分別估計(jì)為2,2和1。在案例A和B中,權(quán)重因子為2; 因此,在校準(zhǔn)曲線回歸模型(4PL或5PL)中,使用了權(quán)重函數(shù)1/Y2。對(duì)于案例C,權(quán)重系數(shù)為 1; 因此,權(quán)重函數(shù)為 1/Y。

為了確定可接受的曲線擬合模型,應(yīng)評(píng)估擬合曲線的4PL與5PL模型(不加權(quán)和加權(quán))回算濃度的累積 %RE和累積 %CV。應(yīng)當(dāng)選擇,在可接受的范圍內(nèi),具有較低的%CV和%RE,校準(zhǔn)點(diǎn)數(shù)量較多的回歸模型。如果兩者都是相當(dāng)?shù)模瑒t選擇加權(quán)4PL模型作為最終曲線擬合模型,進(jìn)行方法驗(yàn)證和樣本分析。根據(jù) FDA 指南,應(yīng)當(dāng)選擇假設(shè)最少的模型,即選擇最簡(jiǎn)單的模型。根據(jù)精密度和準(zhǔn)確度數(shù)據(jù),在所有3個(gè)案例中,4PL都是基于這些標(biāo)準(zhǔn)的最佳回歸模型。

為了驗(yàn)證所選擇回歸模型和權(quán)重函數(shù),可以做其他評(píng)估。例如,在使用權(quán)重函數(shù)之前和之后,可以比較4PL和5PL模型的準(zhǔn)確度和精密度行為。本文給出了4PL與5PL(無(wú)加權(quán)和 1/Y2加權(quán))的累積 %CV 和累積 %RE 的比較,累積 %RE的可接受范圍為± 20%,累積 %CV 的可接受范圍為≤20%。

案例A表明,使用適當(dāng)?shù)臋?quán)重函數(shù)可以提高精密度和準(zhǔn)確性(均低于10%)和擴(kuò)展定量范圍(0.317-178 ng/mL)。在案例B和C中,校準(zhǔn)曲線擬合也有改善。案例B在4PL回歸模型上加權(quán)后,ROQ得到顯著擴(kuò)展:未加權(quán)時(shí)為1.04-48.3 ng/mL;加權(quán)后為 0.602-145 ng/mL;5PL模型,未加權(quán)1.04-145 ng/mL,加權(quán)后0.602-48.3 ng/mL。案例C4PL模型在加權(quán)后ROQ 略有擴(kuò)展:未加權(quán)2.06-79.3 ng/mL;加權(quán)為1.37-79.3 ng/mL。

在定量 LBA 方法開(kāi)發(fā)過(guò)程中,本文介紹了一個(gè)簡(jiǎn)單、易于使用的決策樹(shù),以確定校準(zhǔn)曲線的最佳回歸模型和權(quán)重。所推薦的方法將選擇一個(gè)加權(quán)的曲線擬合模型。

1. 在方法開(kāi)發(fā)過(guò)程中,至少需要使用3個(gè)獨(dú)立的測(cè)試運(yùn)行對(duì)模型選擇進(jìn)行初步評(píng)估; 但是,一般建議增加運(yùn)行的數(shù)量,以便在研究前驗(yàn)證時(shí),驗(yàn)證曲線擬合模型。由于對(duì)響應(yīng)-誤差關(guān)系的估計(jì)存在局限性,因此不建議使用較小的數(shù)據(jù)集合;

2. 評(píng)估異方差性;

3. 如果存在異方差性,就通過(guò)斜率方法確k值(即斜率),然后計(jì)算權(quán)重因子(權(quán)重函數(shù)=1/Y2k);

4. 使用準(zhǔn)確度(%RE)和精密度(%CV)行為來(lái)選擇和驗(yàn)證更好的加權(quán)回歸模型;

5. 建議使用獨(dú)立制備的質(zhì)量控制樣品(QC)來(lái)驗(yàn)證分析方法的定量范圍。

6. 特別聲明

本文如有疏漏和誤讀相關(guān)指南和數(shù)據(jù)的地方,請(qǐng)讀者評(píng)論和指正。所有引用的原始信息和資料均來(lái)自已經(jīng)發(fā)表學(xué)術(shù)期刊, 官方網(wǎng)絡(luò)報(bào)道, 等公開(kāi)渠道, 不涉及任何保密信息。參考文獻(xiàn)的選擇考慮到多樣化但也不可能完備。歡迎讀者提供有價(jià)值的文獻(xiàn)及其評(píng)估。

7. 擴(kuò)展閱讀



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